在水处理工艺中，活性炭过滤器用于对有机物的吸附和对过量氯的吸附去除，对前者去除能力较差，对后者则较强。可以完全脱除余氯，这是由于在对余氯吸附的同时，还有自身被氯化的作用

活性炭的吸附能力曾被用于口服对肠道细菌的吸附而治疗细菌性痢疾，在第一次世界大战中，氯气类毒气作为大规模杀伤性武器被使用，活性炭则是防毒面具中主要的毒气吸附剂，离子交换树脂被广泛应用后，活性炭在化学除盐系统中使用较广，大机组对有机酸的腐蚀敏感，因此配置活性炭床着更多。活性炭吸附水中营养物质，可以成为细菌微生物的温床，微生物膜对水的阻力影响较大，因此应定期进行去污，如果反洗不能奏效时，应进行灭菌处理。

    实际上，按照进水浊度安排合理的饭冲洗制度更具有实际意义，由于微生物膜与微生物粘泥难于清净，采取空气擦洗是必要的。某电热厂用受严重污染的河水作为原水，水中菌、藻和微生物对滤池污染严重。虹吸滤池的运行时间和反洗时间持平。活性炭过滤器无法使用，混床被黏泥结成团块无法分层再生。当活性炭过滤器由于菌藻造成污染时除了加强反洗保证压差在规定范围内之外，灭菌虽属重要，但是更应该从源头解决。

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